Grupo de Genética

Datos de contacto

LABORATORIO 1 - EDIFICIO CIALE

Teléfono y extensiones: 

* Laboratorio: 5111

* Dr. José María Díaz Mínguez: 5121

* Dr. Ernesto Pérez Benito: 5103

* Dr. Michael R. Thon: 5108

Para llamadas desde fuera de la USAL: 923 29 45 00 (centralita) + extensión.

Listado de miembros

NOMBRE CATEGORÍA TITULACIÓN EMAIL
Dr. José María Díaz MínguezCatedrático Universidad josediaz@usal.es
Dr. Michael ThonCatedrático Universidad mthon@usal.es
Dr. Ernesto Pérez BenitoTitular Universidad epbenito@usal.es
Dra. Serenella SuknoTitular Universidad ssukno@usal.es
Dra. Virginia Casado del CastilloContratada Posdoctoral virginiacasado@usal.es
Dra. Flávia RogérioPostdoctoral Juan de la Cierva Formación flavia.rogerio@usal.es
Dr. Francisco Borja Cuevas FernándezContratado Postdoctoral Margarita Salas, USAl-CIB (CSIC) fbcuevas@usal.es
Dª Sioly Becerra ZambranoDoctorando (predoctoral Junta de CyL) sioly@usal.es
D. Pablo García RodríguezContratado Predoctoral CyL pablo97garcia@gmail.com
Dª Azadeth Taati Investigadora Predoctoral azadeh_ta@usal.es
D. Alessandro Gabrielli GarcíaDoctorando (contratado predoctoral CyL) AlessandroGG@usal.es
D. José María García FernándezTécnico de investigación Programa Investigo Junta de CyL chema1298@usal.es
Dª Silvia Gutiérrez SánchezTécnico de investigación Programa Investigo Ministerio de Trabajo y Empleo Social silviags17@usal.es
Dª Lucía Rodríguez MónacoContratada Predoctoral lurodriguezm@usal.es
D. Vlad Paul Mihaila NovacContratado Predoctoral FPI vpaul@usal.es

Listado de proyectos

DURACIÓN TÍTULO
2023-26

Novel global regulators of differentiation and pathogenicity as tools for RNAi targeted control of fungal plant pathogens. (GLORE4RNAi)

REFERENCIA: PID2022-139876NB-I00

NOMBRE DEL IP: José María Díaz Mínguez / Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Ciencia e Innovación

2023-24

Evaluación de la acción de los formulados de DANSTAR FERMENT en el control de la podredumbre gris causado por Botrytis cinerea sobre la vid en condiciones de campo.

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: DANSTAR FERMENT AG

2023-24

Evaluación del efecto de diversas formulaciones experimentales en la incidencia de la podredumbre gris de la vid causada por Botrytis cinerea en condiciones de campo.

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: Lallemand Bio S.L.

2023

Estudios de interacción entre el champiñón (Agaricus bisporus) y sus patógenos fúngicos.

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: ASOCHAMP

2022-24

Repeatómica y genómica de poblaciones del hongo causante de la antracnosis del maíz (REPGEN)

REFERENCIA: PID2021-125349NB-I00

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon, Serenella A. Sukno (Co-IPs)

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Ciencia e Innovación

2022-23

Evaluación de la acción de los formulados de Lallemand en el control de la podredumbre gris sobre racimos de vid en condiciones de invernadero.

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: DANSTAR FERMENT AG

2022

Estudio de genes de patogenicidad en enfermedades de champiñón (Agaricus bisporus)

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: ASOCHAMP

2021

Evaluación del efecto de formulaciones sobre aislados de campo de Botrytis cinerea y análisis del modo de acción

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: Lallemand Bio S.L.

2021

Genes de patogenicidad en enfermedades de champiñón (Agaricus bisporus)

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: ASOCHAMP

2020-23

Identificación de dianas moleculares para el control de precisión de la fusariosis vascular y de la podredumbre gris (MOLTARGETS4PCP).

REFERENCIA: PID2019-110605RB-I00

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Ciencia e Innovación

2019-21

De las poblaciones a los genes: estudio multidisciplinar del agente causal de la antracnosis del maíz Colletotrichum graminicola (POPS2GENES)

REFERENCIA: RTI2018-093611-B-I00

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Ciencia Innovación y Universidades

2018-19

Evaluación del efecto de diversas formulaciones sobre el crecimiento y desarrollo de aislados de campo de Botrytis cinerea

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: Lallemand Bio S.L.

2016-19

Adaptación al entorno: la respuesta a óxido nítrico y utilización de fuentes de carbono vegetales durante el desarrollo y la colonización de cultivos por Botrytis y Fusarium.

NOMBRE DEL IP: José Mª Díaz Mínguez

ENTE FINANCIADOR: Ministerio Economía y Competitividad

2016-19

Del genotipo al fenotipo: Estudios integrados de genómica de poblaciones y genética molecular de hongos causantes de antracnosis (GEN2PHEN: From genotype to phenotype: Integrated population genomic and molecular genetic studies of anthranose causing fungi).

NOMBRE DEL IP: Michael Thon

ENTE FINANCIADOR: Ministerio Economía y Competitividad

2016

Estudio funcional de una serin proteasa potencialmente implicada en la virulencia de Colletotrichum graminicola.

NOMBRE DEL IP: Michael Thon

ENTE FINANCIADOR: Fundación Manuel Solórzano (USAL)

2015-16

Uso de la biología de sistemas para dilucidar la interacción compatible del maíz (Zea mays L.) y del hongo Colletotrichum graminicola: una nueva estrategia en la búsqueda de antifúngicos.

NOMBRE DEL IP: Thon, M.R. y Campos Dias S

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Educación, Cultura y Deporte

2015

Evolution and adaptation of carbohydrate utilization in the Colletotrichum acutatum species complex.

NOMBRE DEL IP: Michael Thon (Investigador colaborador)

ENTE FINANCIADOR: JGI (Joint Genome Institute), Departamento de Energía de los Estados Unidos de América (DOE) (CSP-2015-1661)

2013-16

Caracterización y análisis genómico comparativo de la patogenicidad en el hongo Colletotrichum graminicola, causante de la antracnosis del maíz.

NOMBRE DEL IP: Michael Thon

ENTE FINANCIADOR: J. Castilla y León

2013-15

Análisis Genómico y transcriptómico de las diferencias de virulencia entre aislados de campo en Fusarium oxysporum y en Botrytis cinerea.

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Economía y Competitividad

2013-15

Identificación mediante genómica comparativa y análisis funcional de efectores fúngicos.

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Economía y Competitividad

2012-15

Genomic signatures of pathogenicity and endophytism in five species of grass-associated Colletotrichum impacting the health and production of bioenergy feedstocks, agriculture and the environment.

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon (co-investigador principal)

ENTE FINANCIADOR: Joint Genome Institute (Dpto. Energía EE.UU)

2012

Efectorómica en Colletotrichum graminicola: Análisis bioinformático y funcional de proteínas fúngicas implicadas en la respuesta a la antracnosis.

NOMBRE DEL IP: Michael R Thon

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Ciencia e Innovación

2010-12

Determinantes genéticos que modulan la interacción planta-patógeno en Botrytis y Fusarium.

NOMBRE DEL IP: José María Díaz Mínguez

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Ciencia e Innovación

2010-11

Genome sequencing and genomic comparisaon analyses of C. Acetobutylicumatcc 824- derivative strain SA-1 for optimization of biobutanol production.

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon

ENTE FINANCIADOR: Dpto. Energía EE.UU. (DOE)

2009-11

Análisis bioinformático y funcional de la evolución de genes de patogenicidad en hongos.

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon

ENTE FINANCIADOR: Ministerio de Ciencia e Innovación

2008-10

Aislamiento, caracterizacion y análisis bioinformático de genes expresados in planta en la antracnosis de judía.

NOMBRE DEL IP: Michael Thon

ENTE FINANCIADOR: Junta Castilla y León

2008-09

Identification and analysis of host factors that support brucella infection.

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon

ENTE FINANCIADOR: N.I.H NACIONAL INSTITUTE OF HEALTH

2007-2010

Evaluación e identificación molecular de judías-grano para su cultivo en Castilla y León.

NOMBRE DEL IP: José Mª Díaz Mínguez

ENTE FINANCIADOR: Junta Castilla y León

2007-09

Caracterización genética y diversidad de las poblaciones de hongos patógenos de vid en Castilla y León.

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: ITACYL

2006-10

A genome sequence for the model hemibiotroph colletotrichum graminicola.

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon

ENTE FINANCIADOR: NSF (FUNDACIÓN NACIONAL PARA LA INVESTIGACIÓN) Y USDA (DEPARTAMENTO DE AGRICULTURA DE LOS ESTADOS UNIDOS DE AMÉRICA) PROGRAMA COMPARTIDO

2006-08

Genética molecular del establecimiento y progreso de interacciones patogénicas de botrytis cinerea y fusarium oxysporum.

NOMBRE DEL IP: Ernesto Pérez Benito

ENTE FINANCIADOR: Ministerio Educación y Ciencia

2005-10

Computational and functional genomic approaches to understanding the basis of fungal pathogenesis.

NOMBRE DEL IP: Michael R. Thon

ENTE FINANCIADOR: UNIVERSIDAD DE TEXAS A&M ESTACIÓN EXPERIMENTAL DE AGRICULTURA

Listado de publicaciones

AÑO PUBLICACIÓN
2023

Chromosome-level analysis of the Colletotrichum graminicola genome reveals the unique characteristics of core and minichromosomes.

AUTORES: BECERRA, S.D., BARONCELLI, R., BOUFLEUR, T.R., SUKNO, S.A* AND THON, M.R*

REVISTA/LIBRO: Frontiers in Microbiology 14:1129319. doi: 10.3389/fmicb.2023.1129319

2023

Population genomics provides insights into the global genetic structure of Colletotrichum graminicola, the causal agent of maize anthracnose.

AUTORES: ROGÉRIO, F., BARONCELLI, R., CUEVAS-FERNÁNDEZ, F.B., BECERRA, S. CROUCH. J.A., BETTIOL, W., AZCÁRATE PERIL, M.A., MALAPI-WIGHT, M., ORTEGA, V., BETRAN, J., TENUTA, A., DAMBOLENA, J.S., ESKER, P., REVILLA; P., JACKSON, T., HILTBRUNNER, J., MUNKVOLD, G., BUHINICEK, I., VICENTE-VILLARDÓN, J.L., SUKNO, S.A.*AND THON M.R*.

REVISTA/LIBRO: mBio Dic ;e0287822. https://doi.org/10.1128/mbio.02878-22

2023

The Role of the Fusarium oxysporum FTF2 Transcription Factor in Host Colonization and Virulence in Common Bean Plants (Phaseolus vulgaris L.). (AGL2012-3987-CO2-01: MINECO y PID-2019-110605RB-100: MCIN/ AEI /10.13039/501100011033)

AUTORES: CASADO-DEL CASTILLO, VIRGINIA, BENITO, E.P. AND DÍAZ-MÍNGUEZ, JOSÉ MARÍA

REVISTA/LIBRO: Pathogens 12, 380. https://doi.org/10.3390/pathogens12030380E.

2022

Comparative transcriptomic provides novel insights into the soybean response to Colletotrichum truncatum infection.

AUTORES: BOUFLEUR, T.R., MASSOLA JUNIOR, N.S., BECERRA, S, BARALDI, E, SUKNO, S.A., THON. M.R.* AND BARONCELLI, R.*

REVISTA/LIBRO: Frontiers in Plant Science 13:1046418. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.1046418

2022

In planta gene expression analysis and colonization of Fusarium oxysporum. (PID2019-110605RB-100: MCIN/ AEI /10.13039/501100011033).

AUTORES: CASADO-DEL CASTILLO, VIRGINIA; PÉREZ BENITO, ERNESTO; DÍAZ-MÍNGUEZ, JOSÉ MARÍA

REVISTA/LIBRO: Fusarium wilt. Methods in Molecular Biology, vol 2391. Humana, New York, NY. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-1795-3_12

2022

Influence of Agaricus bisporus establishment and fungicidal treatments on casing soil metataxonomy during mushroom cultivation.

AUTORES: TELLO MARTÍN, M. L., LAVEGA, R., CARRASCO, J. C., PÉREZ, M., PÉREZ-PULIDO, A. J., THON, M. AND PÉREZ BENITO, E.

REVISTA/LIBRO: BMC Genomics. 23:1-12. https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-956209/v1

2022

Means, motive and opportunity for biological invasions: Genetic introgression in a fungal pathogen.

AUTORES: ROGÉRIO, F., OOSTERHOUT, C., GUILLARDI, M.C., CORRER, F.H., HOSAKA, G.H., SANDRINE CROS-ARTEIL, S., MARGARIDO, G.R.A. MASSOLA JÚNIOR, N.S., GLADIEUX, P.

REVISTA/LIBRO: Molecular Ecology. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/mec.16366

2022

Nitric Oxide Metabolism Affects Germination in Botrytis cinerea and Is Connected to Nitrate Assimilation. (AGL2015-66131-C2-1-R : MINECO y PID2019-110605RB-I00: MCIN/ AEI /10.13039/501100011033).

AUTORES: ANTA-FERNÁNDEZ, F., SANTANDER-GORDÓN, D., BECERRA, S., SANTAMARÍA, R., DÍAZ-MÍNGUEZ, J. M., AND BENITO, E. P.

REVISTA/LIBRO: Journal of Fungi. 8:699. https://doi.org/10.3390./jof8070699

2022

The role of plant hormones in the interactions of Colletotrichum species with their host plants.

AUTORES: SVOBODA, T., THON, M.R., STRAUSS, J.

REVISTA/LIBRO: Int. J. Mol. Sci. 22:12454. https://doi.org/10.3390/ijms222212454

2021

A major effect gene controlling development and pathogenicity in B. cinerea identified through genetic analysis of natural mycelial isolates. ( AGL2015-66131-C2-1-R : MINECO y PID2019-110605RB-I00: MCIN/ AEI /10.13039/501100011033)

AUTORES: ACOSTA MOREL, W., ANTA FERNÁNDEZ, F., BARONCELLI, R., BECERRA, S., THON, M.R, BARONCELLI, R., VAN KAN, J., DÍAZ-MÍNGUEZ, J.M., AND PÉREZ BENITO, E.

REVISTA/LIBRO: Frontiers in Plant Sciences https://doi.org/10.3389/fpls.2021.663870

2021

Agrobacterium tumefaciens-Mediated Transformation of NHEJ Mutant Aspergillus nidulans Conidia: An Efficient Tool for Targeted Gene Recombination Using Selectable Nutritional Markers.

AUTORES: CASADO-DEL CASTILLO, V., MACCABE, A. P. AND OREJAS, M.

REVISTA/LIBRO: Journal of Fungi, 7, 961

2021

Complete Genome Sequence of the plant pathogenic fungus Colletotrichum lupini.

AUTORES: BARONCELLI R., PENSEC F., BOUFLEUR, T.R , VICENTE, I., SARROCCO, S. BARALDI, E., PICOT, A., SUKNO S.A., THON M.R AND LE FLOCH G.

REVISTA/LIBRO: MPMI 34:1461-1464. https://doi.org/10.1094/MPMI-07-21-0173-A

2021

Identification and comparison of Colletotrichum secreted effector candidates reveal two independent lineages pathogenic to soybean.

AUTORES: BOUFLEUR, T.R., MASSOLA JUNIOR, N.S., TIKAMI, I., SUKNO, S.A., THON, M.R., AND BARONCELLI, R.

REVISTA/LIBRO: Pathogens 10:1520. (IF:4.53, Q2). https://doi.org/10.3390/pathogens10111520

2021

Soybean anthracnose caused by Colletotrichum species: current status and future prospects.

AUTORES: BOUFLEUR, T.R., CIAMPI-GUILLARDI, M., TIKAMI, I., ROGÉRIO, F., THON, M.R., SUKNO, S.A., MASSOLA JUNIOR, N.S. AND BARONCELLI, R.

REVISTA/LIBRO: MPP 22: 393-409. https://doi.org/10.1111/mpp.13036

2021

Specific tissue proteins 1 and 6 are involved in root biology during normal development and under symbiotic and pathogenic interactions in Medicago truncatula.

AUTORES: ALBORNOS, L., CASADO-DEL-CASTILLO, V., MARTÍN, I., DÍAZ-MÍNGUEZ, J. M., LABRADOR, E. AND DOPICO, B.

REVISTA/LIBRO: Planta, 253, 1-18

2021

The ECHA effectors, a family of conserved fungal secreted chitinases involved in in Suppression of Chitin-Triggered Immunity.

AUTORES: MARTÍNEZ-CRUZ; J., ROMERO, D., HIERREZUELO, J., THON, M.R. DE VICENTE, A. AND PÉREZ-GARCÍA, A.

REVISTA/LIBRO: The Plant Cell The Plant Cell 33: 1319-1340. https://doi.org/10.1093/plcell/koab011.

2020

Dynamic changes in the rice seed microbiome during shoot and root growth derived from seeds.

AUTORES: WANG, M., EYRE, A.W., THON, M.R., OH, Y. AND DEAN, R.A.

REVISTA/LIBRO: Frontiers in Microbiology 11:2183 https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.559728

2020

Genome Sequence Resources of Colletotrichum truncatum, C. plurivorum, C. musicola and C. sojae: Four Species Pathogenic to Soybean (Glycine max L. Merr.).

AUTORES: ROGÉRIO, F., BOUFLEUR, T.R., CIAMPI-GUILLARDI, M., SUKNO, S.A., THON, M.R., MASSOLA JUNIOR, N.S. AND BARONCELLI, R.

REVISTA/LIBRO: Phytopathology 110:1497-1499 https://doi.org/10.1094/PHYTO-03-20-0102-A

2020

Nutritional factors modulating plant and fruit susceptibility to pathogens: BARD workshop, Haifa, Israel, February 25–26, 2018

AUTORES: DOV PRUSKY & LEANDRO JOSÉ DE ASSIS & RICCARDO BARONCELLI & ERNESTO P. BENITO & VIRGINIA CASADO DEL CASTILLO & TIMOTHY CHAYA & SHAY COVO & JOSÉ MARÍA DÍAZ-MÍNGUEZ & NICOLE M. DONOFRIO & EDUARDO ESPESO & TÂNIA RIBEIRO FERNANDES & GUSTAVO H. GOLDMAN & HOWARD JUDELSON & DANIELA NORDZIEKE & ANTONIO DI PIETRO & EDWARD SIONOV & SERENELLA A. SUKNO & MICHAEL R. THON & RICHARD B. TODD & LARS VOLL & JIN RONG XU & BENJAMIN A. HORWITZ & RICHARD A.WILSON

REVISTA/LIBRO: Phytoparasitica doi: 10.1007/s12600-020-00803-w

2019

First report of Colletotrichum graminicola causing maize anthracnose in Bosnia and Herzegovina.

AUTORES: CUEVAS-FERNÁNDEZ, F.B., ROBLEDO-BRIONES, A.M., BARONCELLI, R., TRKULJA, V. THON, M.R., BUHINICEK, I AND SUKNO, S.A.

REVISTA/LIBRO: Plant Disease 103:3281. https://doi.org/10.1094/PDIS-06-19-1224-PDN

2019

Physiological and population genetic analysis of Botrytis field isolates from vineyards in Castilla y León, Spain.

AUTORES: ACOSTA MOREL, W., MARQUES-COSTA, T.M., SANTANDER-GORDÓN, D., ANTA FERNÁNDEZ, F., ZABALGOGEAZCOA, I., VÁZQUEZ DE ALDANA, B.R., SUKNO, S.A., DÍAZ-MÍNGUEZ, J.M. AND BENITO, E.P.

REVISTA/LIBRO: Plant Pathology 68:523-536 https://doi.org/10.1111/ppa.12967

2018

Physiological and population genetic analysis of Botrytis field isolates from vineyards in Castilla y León, Spain.

AUTORES: ACOSTA MOREL, W., MARQUES-COSTA, T.M., SANTANDER-GORDÓN, D., ANTA FERNÁNDEZ, F., ZABALGOGEAZCOA, I., VÁZQUEZ DE ALDANA, B.R., SUKNO, S.A., DÍAZ-MÍNGUEZ, J.M. AND BENITO, E.P.

REVISTA/LIBRO: Plant Pathol. Doi: 10.1111/ppa.12967

2018

Whole-genome sequence of the orchid anthracnose pathogen Colletotrichum orchidophilum.

AUTORES: BARONCELLI, R., SUKNO, S.A., SARROCCO, S., CAFA, G., LE FLOCH, G. AND THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: MPMI (accepted, https://doi.org/10.1094/MPMI-03-18-0055-A).

2017

Analysis of phylogeny, distribution, and pathogenicity of Botryosphaeriaceae species associated with gummosis of Anacardium in Brazil, with a new species of Lasiodiplodia.

AUTORES: NETTO, M. S. B., LIMA, W. G., CORREIA, K. C., DA SILVA, C. F. B., THON, M., MARTINS, R. B., MILLER, R. N. G., MICHEREFF, S. J., AND CÂMARA, M. P. S.

REVISTA/LIBRO: Fungal Biology 121:437-451

2017

Evidence of mixotrophic carbon-capture by n-butanol-producer Clostridium beijerinckii.

AUTORES: SANDOVAL-ESPINOLA WJ, CHINN MS, THON MR, AND BRUNO-BÁRCENA JM.

REVISTA/LIBRO: Scientific Reports 7: 12759

2017

Gapless genome assembly of Colletotrichum higginsianum reveals chromosome structure and association of transposable elements with secondary metabolite gene clusters.

AUTORES: DALLERY, J.-F., LAPALU, N., ZAMPOUNIS, A., PIGNÉ, S., LUYTEN, I., AMSELEM, J., WITTENBERG, A. H. J., ZHOU, S., DE QUEIROZ, M. V., ROBIN, G. P., AUGER, A., HAINAUT, M., HENRISSAT, B., KIM, K.-T., LEE, Y.-H., LESPINET, O., SCHWARTZ, D. C., THON, M. R. AND O’CONNELL, R. J.

REVISTA/LIBRO: BMC Genomics 18: 667

2017

The Colletotrichum acutatum species complex as a model system to study evolution and host specialization in plant pathogens.

AUTORES: BARONCELLI R., TALHINHAS P., PENSEC F., SUKNO S.A, LE FLOCH G. AND THON M.R.

REVISTA/LIBRO: Frontiers in Microbiology 8:2001

2017

Transcriptional analysis of Acinetobacter sp. neg1 capable of degrading ochratoxin A.

AUTORES: LIUZZI, V.C.; FANELLI, F.; TRISTEZZA, M.; HAIDUKOWSKI, M.; PICARDI, E.; MANZARI, C.; LIONETTI, C.; GRIECO, F.; LOGRIECO, A.F.; THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: Front. Microbiol. 2017, 7, 2162

2016

A fungal effector with host nuclear localization and DNA-binding properties is required for maize anthracnose development.

AUTORES: WALTER A. VARGAS, JOSÉ M. SANZ-MARTÍN, GABRIEL E. RECH, VINICIO D. ARMIJOS-JARAMILLO, LINA P. RIVERA, MARÍA MERCEDES ECHEVERRÍA, J. M. DÍAZ-MÍNGUEZ, MICHAEL THON AND SERENELLA SUKNO.

REVISTA/LIBRO: Mol. Plant Microbe Interact. 29 (2): 83-95; doi: 10.1094/MPMI-09-15-0209-R

2016

A highly conserved metalloprotease effector enhances virulence in the maize anthracnose fungus Colletotrichum graminicola.

AUTORES: SANZ-MARTÍN JM, PACHECO-ARJONA JR, BELLO-RICO V, VARGAS WA, MONOD M, DÍAZ-MÍNGUEZ JM, THON MR, SUKNO S.A.

REVISTA/LIBRO: Molecular Plant Pathology 17:1048

2016

Bcmimp1, a Botrytis cinerea Gene Transiently Expressed in planta, Encodes a Mitochondrial Protein.

AUTORES: DAVID BENITO-PESCADOR, DANIELA SANTANDER, M. ARRANZ, JOSÉ M. DÍAZ-MÍNGUEZ, ARTURO P. ESLAVA, JAN A. L. VAN KAN AND ERNESTO P. BENITO.

REVISTA/LIBRO: Front. Microbiol. 7:213. doi: 10.3389/fmicb.2016.00213

2016

Carbon regulation of environment pH by secreted small molecules that modulate pathogenicity in phytpathogenic fungi.

AUTORES: FANGCHENG BI, SHIRI BARAD, DANA MENT, NETA LURIA, AMIT DUBEY, VIRGINIA CASADO, NOFAR GLAM, JOSÉ M. DÍAZ-MÍNGUEZ, EDUARDO ESPESO, ROBERT FLUHR AND DOV PRUSKY.

REVISTA/LIBRO: Mol. Plant Pathol. doi: 10.1111/mpp.12355

2016

Draft whole-genome sequence of the Diaporthe helianthi 7/96 strain, causal agent of sunflower stem canker.

AUTORES: BARONCELLI, R., SCALA, F., VERGARA, M., THON, M. R., AND RUOCCO, M.

REVISTA/LIBRO: Genomics Data 10:151–152.

2016

Expansion of Signal Transduction Pathways in Fungi by Extensive Genome Duplication.

AUTORES: LUIS M. CORROCHANO, ALAN KUO, MARINA MARCET-HOUBEN, SILVIA POLAINO, ASAF SALAMOV, JOSÉ M. VILLALOBOS-ESCOBEDO, JANE GRIMWOOD, M. ISABEL ÁLVAREZ, JAVIER AVALOS, DIANE BAUER, ERNESTO P. BENITO, ISABELLE BENOIT, GERTRAUD BURGER, LOLA P. CAMINO, DAVID CÁNOVAS, ENRIQUE CERDÁ-OLMEDO, JAN-FANG CHENG, ANGEL DOMÍNGUEZ, MAREK ELIAS, ARTURO P. ESLAVA, FABIAN GLASER, GABRIEL GUTIÉRREZ, JOSEPH HEITMAN, BERNARD HENRISSAT, ENRIQUE A. ITURRIAGA, B. FRANZ LANG, JOSÉ L. LAVÍN, SOO CHAN LEE, WENJUN LI, ERIKA LINDQUIST, SERGIO LÓPEZ-GARCÍA, EVA M. LUQUE, ANA T. MARCOS, JOEL MARTIN, KEVIN MCCLUSKEY, HUMBERTO R. MEDINA, ALEJANDRO MIRALLES-DURÁN, ATSUSHI MIYAZAKI, ELISA MUÑOZ-TORRES, JOSÉ A. OGUIZA, ROBIN A. OHM, MARÍA OLMEDO, MARGARITA OREJAS, LUCILA ORTIZ-CASTELLANOS, ANTONIO G. PISABARRO, JULIO RODRÍGUEZ-ROMERO, JOSÉ RUIZ-HERRERA, ROSA RUIZ-VÁZQUEZ, CATALINA SANZ, WENDY SCHACKWITZ, MAHDI SHAHRIARI, EKATERINA SHELEST, FÁTIMA SILVA-FRANCO, DARREN SOANES, KHAJAMOHIDDIN SYED, VÍCTOR G. TAGUA, NICHOLAS J. TALBOT, MICHAEL R. THON, HOPE TICE, RONALD P. DE VRIES, AD WIEBENGA, JAGJIT S. YADAV, EDWARD L. BRAUN, SCOTT E. BAKER, VICTORIANO GARRE, JEREMY SCHMUTZ, BENJAMIN A. HORWITZ, SANTIAGO TORRES-MARTÍNEZ, ALEXANDER IDNURM, ALFREDO HERRERA-ESTRELLA, TONI GABALDÓN, AND IGOR V. GRIGORIEV.

REVISTA/LIBRO: Curr. Biol. 26, 12: 1577-1584

2016

First report of Colletotrichum graminicola causing maize anthracnose stalk rot in the Alentejo region, Portugal.

AUTORES: SANZ-MARTÍN JM, POSTIGO V, MATEOS A, ALBRECHT B, MUNKVOLD GP, THON MR, SUKNO SA.

REVISTA/LIBRO: Plant Disease 100: 1

2016

Gene family expansions and contractions are associated with host range in plant pathogens of the genus Colletotrichum.

AUTORES: BARONCELLI, R., AMBY, D. B., ZAPPARATA, A., SARROCCO, S., VANNACCI, G., LE FLOCH, G., HARRISON, R. J., HOLUB, E., SUKNO, S. A., SREENIVASAPRASAD, S., AND THON, M. R.

REVISTA/LIBRO: BMC Genomics 17:555

2016

Genome Sequence and Annotation of Colletotrichum higginsianum, Causal Agent of Crucifer Anthracnose Disease.

AUTORES: ZAMPOUNIS, A., PIGNÉ, S., DALLERY, J.F., WITTENBERG, A-. ZHOU, S., SCHWARTZ, D., THON, M.R. AND O’CONNELL, R.J.

REVISTA/LIBRO: Genome Announcements, genomeA00821-16

2016

Phylogeny, distribution and pathogenicity of Botryosphaeriaceae species associated with gummosis of Anacardium in Brazil, with a new species of Lasiodiplodia.

AUTORES: NETTO, M. S.B., LIMA, G.W., CORREIA, K.C., DA SILVA C.F.B. PACHECO-ARJONA J.R., THON, M.R., MARTINS, R.B., MICHEREFF, S.J. AND CÁMARA, M.P.S.

REVISTA/LIBRO: Fungal Biology

2016

Survival Trade-offs in Plant Roots during Colonization by Closely Related Beneficial and Pathogenic Fungi.

AUTORES: HACQUARD, S., KRACHER, B., HIRUMA, K., MÜNCH, P.C., GARRIDO-OTER, R., THON, M.R., AARON WEIMANN, A., DAMM, U., DALLERY, J.F., HAINAUT, M., HENRISSAT, B., LESPINET, O., SACRISTAN, S., VER LOREN VAN THEMAAT, E., KEMEN, E., MCHARDY, A.C., SCHULZE-LEFERT P., O’CONNELL, R.J.

REVISTA/LIBRO: Nature Communications 7: 11362

2016

The The FTF gene family regulates virulence and expression of SIX effectors in Fusarium oxysporum.

AUTORES: NIÑO-SÁNCHEZ, JONATHAN, VIRGINIA CASADO-DEL CASTILLO, VEGA TELLO, JOSE. J. DE VEGA-BARTOL., BRISA RAMOS, SERENELLA SUKNO JOSÉ MARÍA AND DÍAZ-MÍNGUEZ.

REVISTA/LIBRO: Mol. Plant PatholOGY 17:1124-1139

2015

Gene expression patterns and dynamics of the colonization of common bean (Phaseolus vulgaris L.) by highly virulent and weakly virulent strains of Fusarium oxysporum.

AUTORES: NIÑO-SÁNCHEZ J, TELLO V, CASADO-DEL CASTILLO V, THON MR, BENITO EP, DÍAZ-MÍNGUEZ JM.

REVISTA/LIBRO: Front Microbiol 2015:234

2015

Identification of horizontally transferred genes in the genus Colletotrichum reveals a steady tempo of bacterial to fungal gene transfer.

AUTORES: ARMIJO-JARAMILLO, V.D., SUKNO, S.A. AND THON M.R.

REVISTA/LIBRO: BMC Genomics 16:2

2015

Molecular diversity of anthracnose pathogen populations associated with UK strawberry production suggests multiple introductions of three different Colletotrichum species.

AUTORES: BARONCELLI, R., ZAPPARATA, A., SARROCCO; S. SUKNO, S.A., LANE, C.R., THON, M.R., VANNACCI, G., HALUB, E. AND SREENIVASAPRASAD, S.

REVISTA/LIBRO: PLoS ONE 10(6): e0129140

2014

Draft Genome Sequence of Colletotrichum acutatum sensu lato (Colletotrichum fioriniae).

AUTORES: BARONCELLI, R., SREENIVASAPRASAD, S., S. SUKNO, S.A., THON, M.R* AND HALUB, E.

REVISTA/LIBRO: Genome Announcements 2: 00112-14

2014

Draft Genome Sequence of Colletotrichum sublineola: a destructive pathogen of cultivated sorghum.

AUTORES: BARONCELLI, R., SANZ-MARTIN, J.M., RECH, G., SUKNO, S.A., THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: Genome Announcements 2: 00540-14

2014

Expansions and contractions of protein families of fungal secretomes reflect a greater impact of phylogenetic history than lifestyle adaptation.

AUTORES: KRIJGER, J., THON, M., DEISING HB. AND WIRSEL, G.R.

REVISTA/LIBRO: BMC Genomics 15:722

2014

First report of apple bit rot caused by Colletotrichum godetiae in the UK.

AUTORES: BARONCELLI, R., SREENIVASAPRASAD, S., THON, M.R. AND SUKNO, S

REVISTA/LIBRO: Plant Disease 98: 7

2014

First report of Colletotrichum acutatum sensu lato causing anthracnose on Vitis vinifera in UK.

AUTORES: BARONCELLI, R., SREENIVASAPRASAD,, S., LANE,, C.R., THON, M.R. AND SUKNO, S.A.

REVISTA/LIBRO: New Disease Reports 29: 26

2014

La podredumbre gris en los viñedos de Castilla y León.

AUTORES: COSTA, T.M.M., BENITO-PESCADOR, D., SANTANDER, D., VÁZQUEZ, C., HERNÁNDEZ, M., ZABALGOGEAZCOA, I., BENAVIDES, P.G. Y BENITO, E.P.

REVISTA/LIBRO: Tierras. 215:100-107.

2014

Natural selection on coding and non-coding DNA sequences is associated with virulence genes in a plant pathogenic fungus.

AUTORES: RECH, G.E., SANZ-MARTÍN, J.M., ANISIMOVA, M., SUKNO, S.A. AND THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: Genome Biology and Evolution 6:2368-2379

2013

Comparative solventogenic analysis and genome sequence of Clostridium beijerinckii SA-1, an offspring of NCIMB 8052.

AUTORES: SANDOVAL, W., MAKWANA, S.T., CHINN, M., THON, M.R., AZCARATE-PERIL, M.A. AND BRUNO-BARCENA, J.M.

REVISTA/LIBRO: Applied and Environmental Microbiology 62: 2558-2570

2013

First report of anthracnose stalk rot of maize caused by Colletotrichum graminicola in Switzerland.

AUTORES: SUKNO, S.A., SANZ-MARTÍN, J.M., GONZÁLEZ-FUENTE, M., HILTBRUNNER, J. AND THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: Plant Disease 98: 694

2013

Global aspects of pacC regulation of pathogenicity genes in Colletotrichum gloeosporioidesas revealed by transcriptome analysis.

AUTORES: ALKAN, N., MENG, X., REUVENI, E., FRIEDLANDER, G.. SUKNO, S. A., SHERMAN, A., THON, M.R., FLUHR, R. AND PRUSKY, D.

REVISTA/LIBRO: MPMI 26: 1345-1358

2013

Horizontal transfer of a subtilisin gene from plants into an ancestor of the plant pathogenic fungal genus Colletotrichum.

AUTORES: V. ARMIJOS-JARAMILLO, VARGAS, W.A., SUKNO, S.A AND THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: PLos One, vol. 8

2013

New insights into the evolution and structure of Colletotrichum plant-like subtilisins (CPLSs).

AUTORES: V. ARMIJOS-JARAMILLO, VARGAS, W.A., SUKNO, S.A AND THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: Communicative & Integrative Biology 6: 1-3

2012

Identification of positive selection in disease response genes within members of the Poaceae.

AUTORES: RECH, G.E., VARGAS, W.A., SUKNO, S.A. AND THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: Plant Signaling and Behavior 7: 1667-1675

2012

Lifestyle transitions in plant pathogenic Colletotrichum fungi deciphered by genome and transcriptome analyses.

AUTORES: O’ CONNELL R.J., THON, M.R., HACQUARD, S., , AMYOTTE, S., KLEEMANN, J., TORRES,M.F., , DAMM, U., BUITE, E., EPSTEIN, L.,M., ALKAN, N., ALTMÜLLER, J., ALVARADO-BALDERRAMA, L., BAUSER, C., BECKER, C., BIRREN, B.W., CHEN, Z., CROUCH, J.A., DUVICK, J., FARMAN, M., GAN, P., HEIMAN, D., HENRISSAT, B., HOWARD, R.J., KABBAGE, M., KOCH, C., KUBO, Y., LAW, A., LEBRUN, M.H., LEE, Y.H. MIYARA, I., MOORE, N.,NEUMANN, U., PANACCIONE, D.G., PANSTRUGA, R., PLACE, M., PROCTOR, R.H., PRUSKY, D., RECH, G., REINHARDT, R., ROLLINS, J.A., ROUNSLEY, S., SCHARDL, C., SCHWARTZ, D.C., SHENOY, N., SHIRASU, K., STÜBER, K., SUKNO, S.A., SWEIGARD, J.A., TAKANO, Y., TAKAHARA, H., VAN DER DOES, H.C., VOLL, L., WILL, I., YOUNG, S., ZENG, Q., ZHANG, J., ZHOU, S., DICKMAN, M., SCHULZE-LEFERT, P.,, VER LOREN VAN THEMAAT, E., MA, L.J. AND VAILLANCOURT, L.J.

REVISTA/LIBRO: Nature Genetics 44: 1060-1065

2012

Plant defense mechanisms are activated during biotrophic and necrotrophic development of Colletotricum graminicola in maize.

AUTORES: VARGAS, W.A., SANZ-MARTÍN, J.M., RECH, G.E., RIVERA, L.P., P BENITO, E., DÍAZ- MÍNGUEZ, J.M., THON, M.R. AND SUKNO, S.A.

REVISTA/LIBRO: Plant Physiology 158:1342-1358.

2012

Quantitative PCR analysis of double-stranded RNA-mediated gene silencing in fungi.

AUTORES: DE VEGA-BARTOL, J.J., TELLO, V., NIÑO-SÁNCHEZ, J., CASADO, V. AND DÍAZ-MÍNGUEZ, J.M.

REVISTA/LIBRO: Laboratory Protocols in Fungal Biology: Current Methods in Fungal Biology. V. Gupta, M. Tuohy, M. Ayyachami, K.M. Turner and A. O’Donovan (eds). Editorial Springer. ISBN 978-1-4614-2355-3.

2012

Role of Nitrogen-Metabolism Genes Expressed during Pathogenicity of the Alkalinizing Colletotrichum gloeosporioides and their Differential Expression in Acidifying Pathogens.

AUTORES: MIYARA, I., SHNAIDERMAN, C., VARGAS, W.A., MENG X., DÍAZ- MÍNGUEZ, J.M., THON, M.R., SHERMAN, A. AND PRUSKY, D.

REVISTA/LIBRO: MPMI 25: 1251-1263

2012

Supervised protein family classification and new family construction.

AUTORES: YI, G., THON, M. SZE, S.H.

REVISTA/LIBRO: Journal of Computational Biology 19: 957-967

2011

A [NiFe]-hydrogenase from Alteromonas macleodii with unusual stability.

AUTORES: VARGAS WA, WEYMAN PD, TONG Y, SMITH HO, XU Q.

REVISTA/LIBRO: Applied and Enviromental Microbiology 77:1990-1998.

2011

Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma.

AUTORES: KUBICEK C.P., ALFREDO HERRERA-ESTRELLA, VERENA SEIDL, DIEGO A. MARTINEZ, IRINA S. DRUZHININA, MICHAEL THON, SUSANNE ZEILINGER, SERGIO CASAS-FLORES, BENJAMIN A. HORWITZ, PRASUN K. MUKHERJEE, MALA MUKHERJEE, LÁSZLÓ KREDICS, LUIS DAVID ALCARAZ, ANDREA AERTS, ZSUZSANNA ANTAL, LEA ATANASOVA, MAYTE GUADALUPE CERVANTES-BADILLO, JEAN CHALLACOMBE, OLGA CHERTKOV, KEVIN MCCLUSKEY, FANNY COULPIER, NANDAN DESHPANDE, HANS VON DÖHREN, DANIEL J. EBBOLE, EDGARDO ULISES ESQUIVEL-NARANJO, ERZSÉBET FEKETE, MICHEL FLIPPHI, FABIAN GLASER, ELIDA YAZMÍN GÓMEZ-RODRÍGUEZ, SABINE GRUBER, CLIFF HAN, BERNARD HENRISSAT, ROSA HERMOSA, MIGUEL HERNÁNDEZ-OÑATE, LEVENTE KARAFFA, IDIT KOSTI, STÉPHANE LE CROM, ERIKA LINDQUIST, SUSAN LUCAS, METTE LUBECK, PETER STEPHENSEN LUBECK, ANTOINE MARGEOT, BENJAMIN METZ, MONICA MISRA, HELENA NEVALAINEN, MARKUS OMANN, NICOLLE PACKER, GIANCARLO PERRONE, EDITH ELENA URESTI-RIVERA, ASAF SALAMOV, MONIKA SCHMOLL, BERNHARD SEIBOTH, HARRIS SHAPIRO, SERENELLA SUKNO, JUAN ANTONIO TAMAYO-RAMOS, DORIS TISCH, ARIC WIEST, HEATHER H. WILKINSON, MICHAEL ZHANG, PEDRO M. COUTINHO, CHARLES M. KENERLEY, ENRIQUE MONTE, SCOTT E., BAKER, IGOR V. GRIGORIEV.

REVISTA/LIBRO: Genome Biology 12: R40.

2011

Diagnostics: the first step of control.

AUTORES: DÍAZ MÍNGUEZ,J.M, ALVESSANTOS,F.M., RAMOS,B., GARCÍASÁNCHEZ,M.A., MARTÍN-RODRÍGUES, N., NÚÑEZ-CORCUERA, B., DE VEGA-BARTOL, J.J., SUKNO, S.A., AND BENITO, E.P.

REVISTA/LIBRO: Control of Fusarium Diseases. F. M. Alves-Santos & J. J. Diez (eds). Editorial Research Signpost, pp. 17-39. ISBN: 978-81-7895-460-8.

2011

Differential roles of alkaline/neutral invertases in Nostoc sp. PCC 7120: Inv-B isoform is essential for diazotrophic growth.

AUTORES: VARGAS WA, NISHI CN, GIARROCCO LE, SALERNO GL.

REVISTA/LIBRO: Planta 233:153-162.

2011

Flux of Nitric Oxide between the necrotrophic pathogen Botrytis cinerea and the host plant.

AUTORES: TURRION-GOMEZ, J.L. AND BENITO, E.P.

REVISTA/LIBRO: Mol. Plant Pathol. 12:606-616.

2011

Heterologous Expression of Alteromonas macleodii and Thiocapsa roseopersicina [NiFe] hydrogenases in Escherichia coli.

AUTORES: WEYMAN PD, VARGAS WA, TONG Y, CHUANG R, SMITH HO, XU Q.

REVISTA/LIBRO: Microbiology 157:1363-1374

2011

New Virulence Groups in Fusarium oxysporum f. sp. phaseoli: The Expression of the Gene Coding for the Transcription Factor ftf1 Correlates with Virulence.

AUTORES: DE VEGA-BARTOL, J. J., MARTÍN-DOMINGUEZ, R., RAMOS, B., GARCÍA-SÁNCHEZ, M.-A., AND DÍAZ-MÍNGUEZ, J. M.

REVISTA/LIBRO: Phytopathology. 101:470–479

2011

Sucrose uptake and metabolism in Trichoderma virens. Control of the association with plant roots is mediated by sucrose metabolism.

AUTORES: VARGAS WA, CRUTCHER FK, KENERLEY CM .

REVISTA/LIBRO: New Phytologist 189:777-789.

2010

Diagnostic sensitivity and specificity of different methods used by two laboratories for the detection of Phytophthora ramorum on multiple natural hosts.

AUTORES: VETTRAINO, A., SUKNO, S., VANNINI, A. AND GARBELOTTO, M.

REVISTA/LIBRO: Plant Pathology 59:289-300

2010

Identifying gene clusters within localized regions in multiple genomes.

AUTORES: YANG, Q., ZHANG, F., YI, G., THON, M.R. AND SZE, S-H.

REVISTA/LIBRO: Journal of Computational Biolgoy, 17: 657-668

2010

PoGO: Prediction of Gene Ontology terms for fungal proteins features.

AUTORES: JUNG, J., YI, G., SUKNO, S., THON, M.R.

REVISTA/LIBRO: BMC Bioinformatics, 11: 215

2010

Protein-DNA interactions in the promoter region of the Phycomyces carB and carRA genes correlate with the kinetics of their mRNA accumulation in response to light.

AUTORES: CATALINA SANZ, ERNESTO P. BENITO, MARGARITA OREJAS, MARÍA I. ÁLVAREZ, ARTURO P. ESLAVA.

REVISTA/LIBRO: Fungal Genet. Biol. 47:773-781

2010

The flavohemoglobin BCFHG1 is the main NO detoxification system and confers protection against nitrosative conditions but is not a virulence factor in the fungal necrotroph Botrytis cinerea.

AUTORES: JUAN LUIS TURRION-GOMEZ, ARTURO P. ESLAVA, ERNESTO P. BENITO.

REVISTA/LIBRO: Fungal Genet. Biol. 47:484-496.